codon_freq.py

codon_freq = {
    'A': {'GCT': 0.16, 'GCC': 0.27, 'GCA': 0.21, 'GCG': 0.36},
    'C': {'TGT': 0.45, 'TGC': 0.55},
    'D': {'GAT': 0.63, 'GAC': 0.37},
    'E': {'GAA': 0.69, 'GAG': 0.31},
    'F': {'TTT': 0.57, 'TTC': 0.43},
    'G': {'GGT': 0.34, 'GGC': 0.4, 'GGA': 0.11, 'GGG': 0.15},
    'H': {'CAT': 0.63, 'CAC': 0.37},
    'I': {'ATT': 0.51, 'ATC': 0.42, 'ATA': 0.07},
    'K': {'AAA': 0.77, 'AAG': 0.23},
    'L': {'TTA': 0.13, 'TTG': 0.13, 'CTT': 0.1, 'CTC': 0.1, 'CTA': 0.04, 'CTG': 0.5},
    'M': {'ATG': 1.0},
    'N': {'AAT': 0.45, 'AAC': 0.55},
    'P': {'CCT': 0.16, 'CCC': 0.12, 'CCA': 0.19, 'CCG': 0.52},
    'Q': {'CAA': 0.35, 'CAG': 0.65},
    'R': {'CGT': 0.38, 'CGC': 0.4, 'CGA': 0.06, 'CGG': 0.1, 'AGA': 0.04, 'AGG': 0.02},
    'S': {'TCT': 0.15, 'TCC': 0.15, 'TCA': 0.12, 'TCG': 0.15, 'AGT': 0.15, 'AGC': 0.28},
    'T': {'ACT': 0.17, 'ACC': 0.44, 'ACA': 0.13, 'ACG': 0.27},
    'V': {'GTT': 0.26, 'GTC': 0.22, 'GTA': 0.15, 'GTG': 0.37},
    'W': {'TGG': 1.0},
    'Y': {'TAT': 0.57, 'TAC': 0.43},
    '*': {'TAA': 0.29, 'TAG': 0.09, 'TGA': 0.62}
}