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<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title>Bibliographie Bioinformatique</title>
<meta name="Description" content="Bibliographie commentée sur le métier de bioinformaticien." />
<link rel="stylesheet" href="site.css" type="text/css"/>
<link rel="icon" href="favicon.ico" />
</head>
<body>
<header>
<img id="banniere" src="images/banniere.png" alt="Bannière" title="Bannière" />
</header>
<div id="contenu">
<div id="intro">
<h2>Recherche documentaire sur la bioinformatique : pourquoi et comment ?</h2>
<p>La bioinformatique est une discipline à l'interface de la biologie et de l'informatique, nécessitant des compétences dans les deux domaines mais également transversables, pour effectuer la liaison. Je me suis demandé quel était le monde de la bioinformatique, les études pour accéder à ce métier et les compétences demandées. Pour ma recherche documentaire, je me suis tout d'abord tourné vers les ressources mises à disposition par le LCS : le CIDJ, le guide des ressources et métier, le moteur de recherche ODEBU... j'y ai trouvé la plupart de mes sources, ainsi que des pistes pour trouver ce qui me manquait. J'ai ensuite majoritairement utilisé le moteur de recherche Ecosia, ainsi que Wikimedia Commons pour trouver des images libres de droit.</p>
<img id="Nuage" src="images/Cloud.png" alt="Nuage de mot" />
</div>
<ul>
<hr />
<h3>·Livre·</h3>
<li class="book">
<div class="source">
<img src="images/Bioinformatique_book.jpg" alt="Couverture du livre" title="Couverture du livre"/>
<p class="biblio"><i>Gilbert Deléage et Manolo Gouy, Bioinformatique [en ligne], éditions Dunod, paru le 21 août 2013, 207p. eISBN : 9782100597604 Disponible en ligne sur : <a href="https://www-dawsonera-com.ressources.univ-poitiers.fr/readonline/9782100597604">https://www-dawsonera-com.ressources.univ-poitiers.fr/readonline/9782100597604</a> (Consulté le 20/10/19)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> Recherche sur le moteur de recherche du SCD "ODEBU", avec comme mot-clef "bioinformatique" et en paramètre "Livres/eBook"</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Ce livre m'a aidé pour me renseigner sur les détails techniques de la pratique de la bioinformatique, notamment pour expliquer concrètement et avec des exemples son utilisation.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Ce livre est un manuel de bioinformatiques avec une grande quantité d'informations, de cas pratiques et d'exemples dans cette discipline.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Périodique·</h3>
<li class="periodik">
<div class="source">
<img src="images/realite_indus.jpg" alt="couverture du périodique" title="Couverture du périodique"/>
<p class="biblio"><i>Jean-Philippe Vert, les applications industrielles de la bioinformatique [en ligne], Annales des Mines - Réalités industrielles, 2013, p. 17-23, Disponible à <a href="https://www-cairn-info.ressources.univ-poitiers.fr/revue-realites-industrielles1-2013-1-page-17.htm#">https://www-cairn-info.ressources.univ-poitiers.fr/revue-realites-industrielles1-2013-1-page-17.htm# </a>(Consulté le 11/10/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête : </b>Recherche sur le moteur de recherche du SCD "ODEBU", avec comme mot-clef "bioinformatique" et en paramètre "périodiques"</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix : </b>Cet article présente de manière concrète les enjeux de la bioinformatique, en fournissant de nombreux exemples et pistes de recherche. Je m'en suis servi pour réaliser une diapo concernant les intérêts et l'impact de la bioinformatique dans différents domaines.</p>
<p class="resume"><b>Résumé : </b>Cet article décrit les différents domaines d'applications de la bioinfiormatique dans les industries biotechnologique, pharmaceutique et dans la santé en général. Ensuite, le sujet des différents marchés en expansion ainsi que des défis que la discipline doit relever.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Site internet·</h3>
<li class="internet">
<div class="source">
<img src="images/timeline_bioinfo.jpg" alt="Chronologie de la bioinformatique" title="Chronologie de la bioinfiormatique"/>
<p class="biblio"><i>Nolwenn Lavielle, Bioinformatique, de sa genèse à nos jours, vue par la génétique, publié le 17/01/2013 sur Bioinfo-fr, Blog. Disponible sur : <a href="https://bioinfo-fr.net/bioinformatique-de-sa-genese-a-nos-jours">https://bioinfo-fr.net/bioinformatique-de-sa-genese-a-nos-jours</a> (Consulté le 02/11/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> Recherche sur le moteur de recherche Ecosia avec comme mots-clefs "bioinformatique histoire"</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Nolwenn Lavielle est une bioinformaticienne ayant travaillé avec l'INSERM et l'institut Pasteur, qui décrit l'histoire et le parcours de la discipline, ce qui est intéressant pour comprendre son intérêt et ses enjeux.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Ce billet de blog présente les points-clefs de l'histoire de la bioinformatique, du point de vue de la génétique. Il retrace son évolution et ses projets marquant, puis conclut en faisant une ouverture sur l'avenir de la bioinformatique.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Site internet·</h3>
<li class="internet">
<div class="source">
<img src="images/sfbi.png" alt="Logo de la SFBI" title="Logo de la SFBI"/>
<p class="biblio"><i>Société Française de Bio-Informatique, La Bioinformatique : métiers et formations | Société Française de BioInformatique [en ligne], Disponible sur : <a href="http://www.sfbi.fr/metiers-formations">http://www.sfbi.fr/metiers-formations </a>(Consulté le 17/10/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> J'ai trouvé le lien vers la SFBI dans la fiche "bioinformaticien/bioinformaticienne" du CIDJ (Centre d'Information et de Documentation Jeunesse), dans la catégorie "en savoir plus".</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Ce site propose de nombreuses informations quand aux formations, métiers et domaine de la bioinformatique, Je l'ai utilisé pour réaliser la partie sur la formation en bioinformatique.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> La SFBI est une association ayant pour but de promouvoir la recherche lpuridisciplinaire en bioinformatique. Elle cherche à réunir des chercheurs, des enseignants et des ingénieurs pour des rassemblements bioinformatiques, comme par exemple la convention nationale de bioinformatique JOBIM. Le site se veut être une vitrine de la recherche et de la formation bioinformatique en France.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Site internet·</h3>
<li class="internet">
<div class="source">
<img src="images/cidj.png" alt="Logo du CIDJ" title="Logo du CIDJ"/>
<p class="biblio"><i>CIDJ, Bio-informaticien/bio-informaticienne [en ligne] Disponible sur <a href="https://www.cidj.com/metiers/bio-informaticien-bio-informaticienne">https://www.cidj.com/metiers/bio-informaticien-bio-informaticienne</a> (Consulté le 11/10/19)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> Dans les ressources documentaires de l'UE.</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Fiche renseignée et complète sur le métier de bioinformaticien, disposant de nombreuses informations utiles.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Fiche de métier de bioinformaticien, détaillant le parcours nécessaire, les opportunités et divers liens vers d'autres ressources pour la bioinformatique.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Image·</h3>
<li class="image">
<div class="source">
<img src="images/periodic_bioinfo.jpg" alt="Table périodique des éléments de la bioinformatique" title="Table périodique des éléments de la bioinformatique"/>
<p class="biblio"><i>Eagle Genomics, The elements of bioinformatics [en ligne] , publié sur Flickr par Dunk le 3 avril 2012, Disponible sur <a href="https://www.flickr.com/photos/dullhunk/6895371690">https://www.flickr.com/photos/dullhunk/6895371690</a> (Consulté le 05/11/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> Sur google "image", en saisissant le mot-clef "bioinformatics", en précisant le paramètre "réutilisation autorisée sans but commercial"</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Cette "image" est intéressante puisqu'elle regroupe et classifie le large panel d'outils qu'un bioinformaticien est amené à utiliser, sous une forme facilement reconnaissable et exploitable : celle du tableau périodique des éléments. L'entreprise à l'origine de sa réalisation, Eagle genomics, est partenaire avec Microsoft Genomics, branche de Microsoft dont le but est de fournir des outils d'analyses de données génétiques.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Ce tableau périodique de la bioinformatique présente la gamme d'outils et de services utiles en bioinformatique, avec pour chacun ou presque, l'année de sortie. Ces outils sont répartis en 3 grandes catégories : les outils libres, les outils gratuits pour les université et les outils commerciaux. A celles-là viennent s'ajouter des sous-catégories, précisant l'utilisation de l'outil.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Image·</h3>
<li class="image">
<div class="source">
<img src="images/researchsome.png" alt="Schéma du Researchsome" title="Schéma du Researchsome"/>
<p class="biblio"><i>Ivan Erill, The Researchsome [en ligne], publié sur Wikimedia Commons par SreeBot le 14 décembre 2011, Disponible sur <a href="https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Erill_2011_EBM_Conference_Researchsome.png">https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Erill_2011_EBM_Conference_Researchsome.png</a> (Consulté le 05/11/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> Sur Wikimedia Commons, en saisissant le mot-clef "bioinformatics".</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Ce schéma réalisé par un professeur de génétique est intéressant car il permet une représentation du monde de la recherche.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Ce schéma représente les interactions entre les différentes disciplines de la recherche en biologie ainsi que certains sujets d'études.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Réseau social·</h3>
<li>
<div class="source">
<img src="images/inospin.svg" alt="Logo d'inospin" title="Logo d'inospin"/>
<p class="biblio"><i>Biowebspin SA,The #1 academia-industry partnering network for scientific innovations - inospin [en ligne]. Disponible sur : <a href="https://www.inospin.com/">https://www.inospin.com/</a> (Consulté le 02/11/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> sur le site du guide des ressources emploi, avec la requête "bioinformatique", j'ai trouvé la fiche "SCIE - industries // Life sciences • Recherche / Biologie • Biochimie • Biotechs • Biomédical • Laboratoires ", puis trouvé ce réseau social dans la catégorie idoine.</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Il s'agit d'un réseau social solidement ancré dans le monde de la recherche et de l'industrie, permettant de mettre en relation facilement des scientifiques et industriels autour du globe.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> Inospin est un réseau social international ayant pour but de mettre en relation des scientifiques ou des entrepreneurs avec des partenaires industriels, ainsi que d'accentuer la collaboration et la recherche d'innovations. Il compte près de 2.5 millions de chercheurs inscrits et plus de 150 partenaires industriels.</p>
</aside>
</li>
<hr />
<h3>·Réseau social·</h3>
<li>
<div class="source">
<img src="images/researchgate.png" alt="Logo de Researchgate" title="Logo de Researchgate"/>
<p class="biblio"><i>ResearchGate, ResearchGate | Find and share Research [en ligne], Disponible sur : <a href="https://www.researchgate.net/">https://www.researchgate.net/</a> (Consulté le 24/11/2019)</i></p>
</div>
<aside>
<p class="request"><b>Requête :</b> sur le site du guide des ressources emploi, avec la requête "bioinformatique", j'ai trouvé la fiche "SCIE - industries // Life sciences • Recherche / Biologie • Biochimie • Biotechs • Biomédical • Laboratoires ", puis trouvé ce réseau social dans la catégorie idoine.</p>
<p class="motif"><b>Motif du choix :</b> Il s'agit d'un réseau social axé sur la collaboration entre scientifiques du monde entier, ayant pour but de réaliser une sorte de "science collaborative". Je l'ai choisi car il se concentre exclusivement sur de l'entraide entre professionnels, et qu'il permet également la lecture libre des publications disponible sur sa plateforme.</p>
<p class="resume"><b>Résumé :</b> ResearchGate est un réseau social qui privilégie l'entraide entre scientifiques. Il se veut être un endroit où chacun peut débattre d'une publication, assister d'autres scientifiques, et mettre en lumière ses propres recherches.</p>
</aside>
</li>
</ul>
</div>
<footer>
<p>Page web réalisée par Benjamin Loire. 2019. <br /> Toutes les images présentes sur le site sont soumises à leur licence d'origine et n'appartiennent pas au site. <br /> Aucun droit réservé.</p>
</footer>
</body>
</html>