-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Expand file tree
/
Copy pathPmOmpH.D00000001
More file actions
290 lines (290 loc) · 20 KB
/
PmOmpH.D00000001
File metadata and controls
290 lines (290 loc) · 20 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 170626.43750 0.0000 0.0000 1 7.70536e+06
10 1295.37927 0.1745 1.5854 21 11386.9
20 344.81671 0.1154 1.0838 41 1017.32
30 157.71541 0.0419 0.4885 62 347.022
40 101.33812 0.0271 0.2471 82 99.6849
50 72.09642 0.0536 0.4254 102 65.344
60 52.26038 0.0247 0.1712 122 24.1265
70 43.41650 0.0186 0.1457 142 11.4322
80 37.16209 0.0221 0.1525 162 9.75196
90 32.26722 0.0153 0.0933 182 8.13078
99 29.30634 0.0194 0.1198 201 6.06586
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 334.14276 0.0000 0.0000 1 505.45
10 310.78275 0.0115 0.0953 21 508.041
20 296.95187 0.0055 0.0373 42 197.438
30 282.33569 0.0147 0.1407 62 356.78
40 263.74631 0.0148 0.1361 82 207.851
50 253.47400 0.0111 0.0801 102 186.918
60 245.01140 0.0033 0.0214 124 134.778
70 237.66965 0.0093 0.0651 146 136.949
80 230.31387 0.0099 0.0653 166 133.567
90 224.13951 0.0050 0.0400 186 95.2237
94 223.07684 0.0006 0.0067 195 20.335
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1177.55566 0.0000 0.0000 1 678.602
1 1177.05176 0.0005 0.0059 3 1003.88
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 2640.47827 0.0000 0.0000 1 6776.27
1 2638.37891 0.0006 0.0075 3 7404.94
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 3569.71313 0.0000 0.0000 1 21017.9
10 3260.53174 0.0151 0.1445 21 37535.1
20 3077.02783 0.0062 0.0755 42 25547.4
30 2940.62012 0.0097 0.1429 62 20551.3
40 2840.60352 0.0044 0.0801 83 9352.78
50 2762.74365 0.0068 0.1025 103 11260.4
60 2707.79688 0.0051 0.0608 123 14471.5
70 2644.06030 0.0061 0.1548 143 14797.1
80 2584.26831 0.0057 0.1197 163 8876.37
90 2542.87402 0.0052 0.0673 183 7581.3
99 2509.62817 0.0065 0.0596 201 8162.57
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 3371.16870 0.0000 0.0000 1 21752
10 3168.22412 0.0131 0.1471 22 85723.8
20 3012.01953 0.0075 0.0779 42 20634.6
30 2890.24805 0.0028 0.0660 63 19166.9
40 2811.65137 0.0056 0.1402 84 13279.8
50 2754.41772 0.0085 0.1186 104 10055.4
60 2708.99390 0.0082 0.0839 124 10145.6
70 2656.14014 0.0122 0.0754 144 9503.21
80 2606.75732 0.0075 0.0536 164 9140.09
90 2563.90259 0.0086 0.0596 184 7472.93
99 2532.35913 0.0117 0.0850 201 6812.08
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 3765.27686 0.0000 0.0000 1 22831.1
10 3445.88892 0.0119 0.2392 22 131388
20 3217.60669 0.0064 0.1735 42 38825.8
30 3080.84619 0.0093 0.1203 63 46651
40 3020.79858 0.0035 0.0659 83 12840.8
50 2948.24756 0.0051 0.0936 103 13101.9
60 2871.98633 0.0065 0.0943 123 12752.7
70 2809.80176 0.0026 0.0285 144 10266.3
80 2750.76660 0.0067 0.0899 164 5646.24
90 2706.72534 0.0059 0.0638 184 8477.16
99 2669.78638 0.0058 0.0638 201 9990.21
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 2808.04956 0.0000 0.0000 1 8681.71
1 2805.87231 0.0006 0.0100 3 5599.66
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 3658.26489 0.0000 0.0000 1 17813.1
10 3392.41968 0.0080 0.0813 21 59273.7
20 3216.44141 0.0022 0.0188 42 17117
30 3138.72681 0.0059 0.1496 62 16865.8
40 3082.87817 0.0066 0.0882 82 12610
50 3036.84180 0.0025 0.0350 103 7477.3
60 3000.31982 0.0070 0.0932 123 8711.61
70 2963.46021 0.0056 0.0807 143 6322.24
80 2936.17993 0.0038 0.0370 163 3321.51
90 2921.29004 0.0021 0.0186 183 2599.77
99 2897.15454 0.0043 0.0554 201 6068.25
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 4268.10986 0.0000 0.0000 1 164118
10 3493.59326 0.0072 0.0943 21 44233.9
20 3338.86230 0.0030 0.0597 41 14909.3
30 3231.68384 0.0035 0.0769 62 14496.6
40 3172.67798 0.0041 0.1070 83 10477.5
50 3127.81665 0.0042 0.0786 103 6625.96
60 3089.23999 0.0071 0.1388 123 15198.5
70 3042.45752 0.0037 0.0908 143 6536.9
80 3016.97095 0.0035 0.0470 164 4514.45
90 2994.12939 0.0041 0.0586 184 3679.46
97 2983.63818 0.0007 0.0085 199 2243.33
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 4322.69971 0.0000 0.0000 1 863485
10 3225.29883 0.0037 0.0825 21 18084.1
20 3159.03052 0.0035 0.1157 41 10220.5
30 3120.81860 0.0036 0.1119 61 5865.19
37 3105.50537 0.0006 0.0098 76 3473.15
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 3235.56152 0.0000 0.0000 1 92002.5
10 3139.73950 0.0015 0.0384 21 28258.3
20 3114.31714 0.0019 0.0373 41 5787.53
30 3089.06738 0.0045 0.0494 61 6411.16
40 3063.43945 0.0041 0.0513 81 4612.79
50 3041.80322 0.0034 0.0435 101 3987.71
60 3017.73804 0.0040 0.0472 121 4480.27
70 2998.74023 0.0045 0.0572 141 3328.03
80 2984.03638 0.0050 0.0633 161 2992.34
90 2969.48340 0.0027 0.0238 181 2547.51
# Molecular dynamics simulation at 150.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 2956.83081 0.0000 0.0000 1158.69067 146.95139
10 3645.27246 0.0152 0.0428 654.05847 82.95121
20 3848.96606 0.0185 0.0539 970.85059 123.12849
30 3986.57642 0.0190 0.0574 1027.02002 130.25220
40 4003.34644 0.0201 0.0698 1148.49231 145.65797
50 4072.65088 0.0197 0.0605 1100.47571 139.56825
# Molecular dynamics simulation at 400.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 4072.65088 0.0000 0.0000 1182.72864 150.00002
10 4067.35938 0.0210 0.0594 1235.20801 156.65573
20 4951.75830 0.0281 0.0830 2255.72705 286.08344
30 5388.43115 0.0321 0.1027 2952.43384 374.44354
40 5414.23926 0.0316 0.1390 2872.11597 364.25720
50 5566.47363 0.0331 0.1195 3155.78101 400.23312
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 5566.47363 0.0000 0.0000 3153.94238 399.99994
10 5591.26270 0.0324 0.1094 2991.47485 379.39493
20 7622.76074 0.0459 0.1642 6134.70557 778.03638
30 8256.38672 0.0503 0.1779 7276.48926 922.84351
40 9009.62988 0.0496 0.1742 7102.11377 900.72827
50 9269.60645 0.0512 0.1837 7554.05371 958.04572
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 9269.60645 0.0000 0.0000 7884.85449 999.99963
10 9394.15723 0.0515 0.1988 7655.89502 970.96179
20 9427.86816 0.0525 0.2081 7818.26074 991.55389
30 9483.33789 0.0513 0.2122 7566.42969 959.61530
40 9488.67090 0.0518 0.2042 7694.16455 975.81531
50 9532.72070 0.0517 0.1686 7654.54590 970.79071
60 9604.89746 0.0510 0.1638 7461.23926 946.27448
70 9449.35254 0.0516 0.1677 7564.72217 959.39874
80 9572.61328 0.0516 0.1723 7535.91553 955.74536
90 9510.46875 0.0517 0.1471 7560.64355 958.88147
100 9566.84375 0.0517 0.1556 7599.83057 963.85138
110 9678.10156 0.0522 0.1829 7747.24170 982.54688
120 9456.92676 0.0528 0.1668 7858.57422 996.66663
130 9682.47266 0.0522 0.1483 7724.24658 979.63049
140 9814.77734 0.0526 0.1513 7766.75391 985.02148
150 9603.12402 0.0522 0.1677 7747.31152 982.55573
160 9795.27051 0.0521 0.1607 7641.23389 969.10236
170 9533.72559 0.0528 0.1783 7876.54688 998.94604
180 9801.80664 0.0522 0.1829 7696.04053 976.05328
190 9611.89355 0.0525 0.1712 7832.61914 993.37488
200 9788.99609 0.0521 0.1716 7636.40430 968.48987
210 9869.13867 0.0533 0.1564 7955.00537 1008.89655
220 9763.79492 0.0530 0.1582 7886.93408 1000.26343
230 9708.22070 0.0531 0.1687 7976.01514 1011.56116
240 9759.49023 0.0531 0.1511 7929.96436 1005.72076
250 9736.74414 0.0529 0.1544 7911.73438 1003.40869
260 9862.73145 0.0531 0.1444 7959.88965 1009.51599
270 9851.94629 0.0528 0.1572 7805.18018 989.89496
280 9846.70508 0.0524 0.2062 7770.83594 985.53918
290 9806.91016 0.0527 0.1546 7862.26074 997.13422
300 9923.97070 0.0524 0.1583 7796.19531 988.75543
# Molecular dynamics simulation at 800.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 9923.97070 0.0000 0.0000 7884.86572 1000.00110
10 9947.52930 0.0528 0.1436 7842.84814 994.67218
20 10014.73926 0.0526 0.1468 7805.03467 989.87646
30 9936.15625 0.0527 0.1636 7825.97705 992.53253
40 9820.34668 0.0530 0.1666 7916.94824 1004.06995
50 9901.79297 0.0527 0.1665 7889.32178 1000.56622
60 9739.89258 0.0532 0.1837 7968.76514 1010.64166
70 9721.75098 0.0535 0.1780 8060.05762 1022.21985
80 9791.00488 0.0534 0.1656 8035.47900 1019.10266
90 9900.09961 0.0529 0.1637 7936.59180 1006.56128
100 9846.27246 0.0530 0.1602 7901.99072 1002.17297
110 9149.18262 0.0503 0.1644 7066.42090 896.20154
120 9069.35840 0.0499 0.1420 7048.30664 893.90417
130 9181.59668 0.0499 0.1428 7041.10791 892.99115
140 9076.53223 0.0500 0.1346 7093.47900 899.63318
150 8983.81055 0.0508 0.1447 7294.29346 925.10156
160 8961.87891 0.0504 0.1386 7149.88379 906.78674
170 9074.37305 0.0504 0.1400 7135.72461 904.99097
180 9133.20410 0.0500 0.1361 7071.91895 896.89880
190 9094.79297 0.0505 0.1520 7165.13721 908.72125
200 9080.26367 0.0504 0.1386 7103.03564 900.84521
210 8860.63086 0.0484 0.1501 6618.33984 839.37347
220 8786.51172 0.0484 0.1383 6605.15283 837.70099
230 8738.03418 0.0486 0.1377 6647.94092 843.12762
240 8757.88281 0.0486 0.1342 6656.03027 844.15356
250 8754.90234 0.0488 0.1327 6690.64160 848.54315
260 8667.57715 0.0490 0.1312 6719.38477 852.18854
270 8780.37891 0.0487 0.1305 6659.44629 844.58679
280 8890.56445 0.0484 0.1389 6584.48193 835.07941
290 8756.78516 0.0486 0.1340 6633.83691 841.33887
300 8873.97363 0.0484 0.1376 6559.04395 831.85321
# Molecular dynamics simulation at 500.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 8873.97363 0.0000 0.0000 6307.88818 800.00031
10 8647.69824 0.0484 0.1495 6578.50537 834.32141
20 8578.37109 0.0481 0.1307 6517.54736 826.59039
30 8587.86914 0.0483 0.1559 6582.95068 834.88519
40 8533.33203 0.0487 0.1441 6651.15967 843.53583
50 8649.77734 0.0483 0.1427 6534.27100 828.71143
60 8605.93457 0.0481 0.1361 6564.71094 832.57196
70 8553.96289 0.0484 0.1277 6602.00391 837.30164
80 8686.16309 0.0481 0.1350 6512.90723 826.00195
90 8563.64648 0.0488 0.1337 6654.34082 843.93927
100 8555.59961 0.0488 0.1440 6659.57959 844.60370
110 7415.84863 0.0429 0.1363 5224.03760 662.54053
120 7289.45361 0.0425 0.1402 5082.46045 644.58496
130 7377.67480 0.0431 0.1366 5227.18652 662.93994
140 7209.58643 0.0430 0.1209 5200.73389 659.58502
150 7398.18701 0.0433 0.1187 5272.30908 668.66260
160 7193.15674 0.0434 0.1294 5299.62695 672.12720
170 7343.26270 0.0428 0.1232 5174.31201 656.23407
180 7263.08447 0.0436 0.1380 5307.70703 673.15198
190 7299.19824 0.0434 0.1203 5243.06445 664.95361
200 7244.63916 0.0436 0.1365 5345.39258 677.93146
210 6657.58643 0.0400 0.1134 4493.44238 569.88251
220 6676.43848 0.0397 0.1158 4423.72363 561.04041
230 6610.30273 0.0399 0.1112 4500.24219 570.74493
240 6602.77197 0.0399 0.1120 4485.42920 568.86627
250 6646.06641 0.0402 0.1200 4572.52246 579.91187
260 6518.57275 0.0403 0.1134 4578.45654 580.66449
270 6634.10840 0.0404 0.1061 4556.84961 577.92419
280 6556.85791 0.0404 0.1058 4592.25342 582.41431
290 6611.65674 0.0402 0.1064 4525.22656 573.91357
300 6591.38086 0.0403 0.1162 4581.08545 580.99792
# Molecular dynamics simulation at 300.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 6591.38086 0.0000 0.0000 3942.42627 499.99969
10 6257.22998 0.0390 0.1105 4262.20996 540.55640
20 6262.18652 0.0387 0.1005 4171.75049 529.08386
30 6298.37451 0.0388 0.1093 4224.38818 535.75964
40 6284.45654 0.0389 0.1142 4245.72070 538.46515
50 6298.32861 0.0388 0.1191 4228.38428 536.26642
60 6205.81006 0.0392 0.1160 4314.85205 547.23273
70 6297.60596 0.0389 0.1069 4270.73486 541.63757
80 6278.17139 0.0387 0.1084 4209.61279 533.88574
90 6276.19629 0.0390 0.1284 4264.01660 540.78552
100 6335.24707 0.0390 0.1250 4236.83496 537.33820
110 5433.04492 0.0345 0.0878 3315.62866 420.50586
120 5348.54834 0.0340 0.0964 3247.42407 411.85577
130 5404.61914 0.0345 0.0969 3339.82178 423.57416
140 5349.48193 0.0343 0.0916 3294.21997 417.79071
150 5341.24365 0.0347 0.1086 3396.15112 430.71814
160 5363.78516 0.0348 0.1088 3356.70972 425.71597
170 5361.01221 0.0345 0.0910 3342.97534 423.97412
180 5319.60107 0.0348 0.1091 3411.66626 432.68585
190 5393.23193 0.0345 0.0989 3347.48047 424.54547
200 5347.58447 0.0344 0.0979 3317.07764 420.68964
210 4999.52100 0.0317 0.0874 2831.90723 359.15771
220 4870.57373 0.0317 0.0895 2818.28369 357.42990
230 4933.84619 0.0320 0.0852 2869.18872 363.88596
240 4872.49658 0.0318 0.0914 2857.17090 362.36179
250 4930.97949 0.0318 0.0891 2848.71021 361.28876
260 4847.24121 0.0320 0.0943 2888.63062 366.35168
270 4908.69727 0.0318 0.0844 2817.76221 357.36377
280 4933.84375 0.0318 0.0989 2849.49878 361.38876
290 4898.05957 0.0319 0.0863 2857.82837 362.44516
300 4863.98633 0.0322 0.0845 2889.84668 366.50589
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 4863.98633 0.0000 0.0000 1 4.1855e+06
10 2615.64136 0.0114 0.0495 21 61480.9
20 2401.46289 0.0087 0.0402 41 24600.4
30 2309.21094 0.0065 0.0273 61 12649.5
40 2257.45215 0.0051 0.0251 81 8579.53
50 2224.12549 0.0035 0.0194 101 8457.27
60 2197.59375 0.0052 0.0284 121 4062.89
70 2178.82788 0.0033 0.0195 141 3268.67
80 2166.00220 0.0016 0.0106 161 1252.55
82 2164.01660 0.0016 0.0094 165 999.183