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Xuwznlnq434343Mile-AwayTablewareBoxElijahChang929
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更新构建 (#73)
* Device visualization (#39) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 498c997. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 3a60d2a. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commit fa72722, reversing changes made to 498c997. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * add biomek.py demo implementation * 更新LiquidHandlerBiomek类,添加资源创建功能,优化协议创建方法,修复部分代码格式问题,更新YAML配置以支持新功能。 * Test * fix biomek success type * Convert LH action to biomek. * Update biomek.py * 注册表上报handle和schema (param input) * 修复biomek缺少的字段 * delete 's' * Remove warnings * Update biomek.py * Biomek test * Update biomek.py * 新增transfer_biomek的msg * New transfer_biomek * Updated transfer_biomek * 更新transfer_biomek的msg * 更新transfer_biomek的msg * 支持Biomek创建 * new action * fix key name typo * New parameter for biomek to run. * Refine * Update * new actions * new actions * 1 * registry * fix biomek startup add action handles * fix handles not as default entry * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * biomek_test.py biomek_test.py是最新的版本,运行它会生成complete_biomek_protocol.json * Update biomek.py * biomek_test.py * fix liquid_handler.biomek handles * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 56d45b9. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 07d9db2. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * host node新增resource add时间统计 create_resource新增handle bump version to 0.9.2 * 修正物料上传时间 改用biomek_test 增加ResultInfoEncoder 支持返回结果上传 * 正确发送return_info结果 * 同步执行状态信息 * 取消raiseValueError提示 * Update biomek_test.py * 0608 DONE * 同步了Biomek.py 现在应可用 * biomek switch back to non-test * temp disable initialize resource * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit 5d9953c. * Reapply "change to debug level" This reverts commit 2487bb6. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> * fix move it * Test * Convert LH action to biomek. * 新增transfer_biomek的msg * new actions * 1 * fix liquid_handler.biomek handles * biomek_test.py * 0608 DONE * Device visualization (#42) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 498c997. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 3a60d2a. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commit fa72722, reversing changes made to 498c997. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 56d45b9. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 07d9db2. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit 5d9953c. * Reapply "change to debug level" This reverts commit 2487bb6. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * Add Mock Device for Organic Synthesis\添加有机合成的虚拟仪器和Protocol (#43) * Add Device MockChiller Add device MockChiller * Add Device MockFilter * Add Device MockPump * Add Device MockRotavap * Add Device MockSeparator * Add Device MockStirrer * Add Device MockHeater * Add Device MockVacuum * Add Device MockSolenoidValve * Add Device Mock \_init_.py * 规范模拟设备代码与注册表信息 * 更改Mock大写文件夹名 * 删除大写目录 * Edited Mock device json * Match mock device with action * Edit mock device yaml * Add new action * Add Virtual Device, Action, YAML, Protocol for Organic Syn * 单独分类测试的protocol文件夹 * 更名Action --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * 测试自动构建 * try build fix * try build * create container * container 添加和更新完成 * Device registry port (#49) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * unify liquid_handler definition * Update virtual_device.yaml * 更正了stir和heater的连接方式 * 区分了虚拟仪器中的八通阀和电磁阀,添加了两个阀门的驱动 * 修改了add protocol * 修复了阀门更新版的bug * 修复了添加protocol前缀导致的不能启动的bug * Fix handles * bump version to 0.9.6 * add resource edge upload * update container registry and handles * add virtual_separator virtual_rotavap fix transfer_pump * fix container value add parent_name to edge device id * 大图的问题都修复好了,添加了gassource和vacuum pump的驱动以及注册表 * default resource upload mode is false * 添加了icon的文件名在注册表里面 * 修改了json图中link的格式 * fix resource and edge upload * fix device ports * Fix edge id * 移除device的父节点关联 * separate registry sync and resource_add * 默认不进行注册表报送,通过命令unilabos-register或者增加启动参数 * 完善tip * protocol node不再嵌套显示 * bump version to 0.9.7 新增一个测试PumpTransferProtocol的teststation,亲测可以运行,将八通阀们和转移泵与pump_protocol适配 * protocol node 执行action不应携带自身device id * 添加了一套简易双八通阀工作站JSON,亲测能跑 * 修复了很多protocol,亲测能跑 * 添加了run column和filter through的protocol,亲测能跑 * fix mock_reactor * 修改了大图和小图的json,但是在前端上没看到改变 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 支持通过导入方式补全注册表,新增工作流unilabos_device_id字段 * Create 5 new protocols & bump version 0.9.8 (#59) * 添加了5个缺失的protocol,验证了可以运行 * bump version to 0.9.8 * 修复新增的Action的字段缺失 --------- Co-authored-by: Xuwznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * Update work_station.yaml (#60) * Update work_station.yaml * Checklist里面有XDL跟protocol之间没对齐的问题,工作量有点大找时间写完 * 更新中析仪器,以及启动示例 * 更新实例 * 更新实例 * 更新实例 * 修正prcxi启动 * 更新PRCXI配置,修改主机地址和设置状态,并添加示例用法 * Add plateT6 to PRCXI configuration and enhance error handling in liquid handling * 不生成已配置action的动作,增加prcxi的debug模式 * 更新axis等参数 * deck * 新增set liquid方法 * modify prcxi * registry upadte * Update * update * container_for_nothing * Update * SET TIP RACK * update registry version & category * fix: Protocol node resource run (#65) * stir和adjustph的中的bug修不好 * fix sub-resource query in protocol node compiling * add resource placeholder to vessels * add the rest yaml * Update work_station.yaml --------- Co-authored-by: KCFeng425 <2100011801@stu.pku.edu.cn> * 采用http报送resource * 采用http报送resource * Update for prcxi * Update * Update * Refactor PRCXI9300Deck initialization and update plate configurations - Changed deck name from "PRCXI_Deck" to "PRCXI_Deck_9300". - Updated plate4 initialization to use get_well_container instead of get_tip_rack. - Modified plate4 material details with new UUID, code, and name. - Renamed output JSON file to "deck_9300_new.json". - Uncommented and adjusted liquid handling operations for clarity and future use. * test * update * Delete unnecessary files. * Device visualization (#67) * Update README and MQTTClient for installation instructions and code improvements * feat: 支持local_config启动 add: 增加对crt path的说明,为传入config.py的相对路径 move: web component * add: registry description * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * feat: node_info_update srv fix: OTDeck cant create * close #12 feat: slave node registry * feat: show machine name fix: host node registry not uploaded * feat: add hplc registry * feat: add hplc registry * fix: hplc status typo * fix: devices/ * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * fix: device.class possible null * fix: HPLC additions with online service * fix: slave mode spin not working * fix: slave mode spin not working * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * feat: 多ProtocolNode 允许子设备ID相同 feat: 上报发现的ActionClient feat: Host重启动,通过discover机制要求slaveNode重新注册,实现信息及时上报 * feat: 支持env设置config * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * Device visualization (#14) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: missing hostname in devices_names fix: upload_file for model file * fix: missing paho-mqtt package bump version to 0.9.0 * fix startup add ResourceCreateFromOuter.action * fix type hint * update actions * update actions * host node add_resource_from_outer fix cmake list * pass device config to device class * add: bind_parent_ids to resource create action fix: message convert string * fix: host node should not be re_discovered * feat: resource tracker support dict * feat: add more necessary params * feat: fix boolean null in registry action data * feat: add outer resource * 编写mesh添加action * feat: append resource * add action * feat: vis 2d for plr * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate * Device visualization (#22) * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * add 3d visualization * 完成在main中启动设备可视化 完成在main中启动设备可视化,并输出物料ID:mesh的对应关系resource_model 添加物料模型管理类,遍历物料与resource_model,完成TF数据收集 * 完成TF发布 * 修改模型方向,在yaml中添加变换属性 * 添加物料tf变化时,发送topic到前端 另外修改了物料初始化的方法,防止在tf还未发布时提前建立物料模型与发布话题 * 添加关节发布节点与物料可视化节点进入unilab * 使用json启动plr与3D模型仿真 * 完成启动OT并联动rviz * 修复rviz位置问题, 修复rviz位置问题, 在无tf变动时减缓发送频率 在backend中添加物料跟随方法 * fix: running logic * fix: running logic * fix: missing ot * 在main中直接初始化republisher和物料的mesh节点 * 将joint_republisher和resource_mesh_manager添加进 main_slave_run.py中 * 编写mesh添加action * add action * fix * fix: browser on rviz * fix: cloud bridge error fallback to local * fix: salve auto run rviz * 初始化两个plate --------- Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> * fix: multi channel * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * fix: aspirate * 提交 * fix: jobadd * fix: jobadd * fix: msg converter * tijiao * add resource creat easy action * identify debug msg * mq client id * 提取lh的joint发布 * unify liquid_handler definition * 修改物料跟随与物料添加逻辑 修改物料跟随与物料添加逻辑 将joint_publisher类移出lh的backends,但仍需要对lh的backends进行一些改写 * Revert "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 498c997. * Reapply "修改物料跟随与物料添加逻辑" This reverts commit 3a60d2a. * Revert "Merge remote-tracking branch 'upstream/dev' into device_visualization" This reverts commit fa72722, reversing changes made to 498c997. * 修改物料放下时的方法,如果选择 修改物料放下时的方法, 如果选择drop_trash,则删除物料显示 如果选择drop,则让其解除连接 * unilab添加moveit启动 1,整合所有moveit节点到一个move_group中,并整合所有的controller依次激活 2,添加pymoveit2的节点,使用json可直接启动 3,修改机械臂规划方式,添加约束,让冗余关节不会进行过多移动 * 修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题, * Revert "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 56d45b9. * Reapply "修改物体attach时,多次赋值当前时间导致卡顿问题," This reverts commit 07d9db2. * 添加缺少物料:"plate_well_G12", * add * fix tip resource data * liquid states * change to debug level * Revert "change to debug level" This reverts commit 5d9953c. * Reapply "change to debug level" This reverts commit 2487bb6. * fix tip resource data * add full device * add moveit yaml * 修复moveit 增加post_init阶段,给予ros_node反向 * remove necessary node * fix moveit action client * remove necessary imports * Update moveit_interface.py * fix handler_key uppercase * json add liquids * fix setup * add * change to "sources" and "targets" for lh * bump version * remove parent's parent link * change arm's name * change name * fix ik error * 修改moveit_interface,并在mqtt上报时发送一个时间戳 * 添加机械臂和移液站 * 添加 * 添加硬件 * update * 添加 --------- Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: wznln <18435084+Xuwznln@users.noreply.github.com> Co-authored-by: zhangshixiang <@zhangshixiang> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> * 更新注册表 * 使用rattler-build进行构建测试 * dev 发版测试 * dev 发版测试 * dev 发版测试 * dev 发版测试 * 更新readme * add post link when installing * sync main * bump version to 0.10.2 * 添加环境检查功能,支持自动安装缺失的Python包;更新命令行参数以跳过环境检查;优化代码格式。 * 移除post-link脚本,更新构建配置以支持多平台构建,调整依赖项以适应不同操作系统。 --------- Co-authored-by: q434343 <73513873+q434343@users.noreply.github.com> Co-authored-by: Harvey Que <Q-Query@outlook.com> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@pku.edu.cn> Co-authored-by: Guangxin Zhang <guangxin.zhang.bio@gmail.com> Co-authored-by: qxw138 <qxw@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: Kongchang Feng <2100011801@stu.pku.edu.cn> Co-authored-by: Junhan Chang <changjh@dp.tech>
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-15
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9 files changed

+266
-15
lines changed

.conda/recipe.yaml

Lines changed: 4 additions & 3 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,13 +1,12 @@
11
package:
22
name: unilabos
3-
version: 0.10.1
3+
version: 0.10.2
44

55
source:
66
path: ../unilabos
77
target_directory: unilabos
88

99
build:
10-
noarch: python
1110
script:
1211
- set PIP_NO_INDEX=
1312
- if: win
@@ -33,8 +32,10 @@ requirements:
3332
- conda-forge::python ==3.11.11
3433
- compilers
3534
- cmake
36-
- make
3735
- ninja
36+
- if: unix
37+
then:
38+
- make
3839
- sphinx
3940
- sphinx_rtd_theme
4041
- numpy

.github/workflows/unilabos-conda-build.yml

Lines changed: 42 additions & 2 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -8,6 +8,10 @@ on:
88
branches: [main, dev]
99
workflow_dispatch:
1010
inputs:
11+
platforms:
12+
description: '选择构建平台 (逗号分隔): linux-64, osx-64, osx-arm64, win-64'
13+
required: false
14+
default: 'linux-64'
1115
upload_to_anaconda:
1216
description: '是否上传到Anaconda.org'
1317
required: false
@@ -16,7 +20,20 @@ on:
1620

1721
jobs:
1822
build:
19-
runs-on: ubuntu-latest
23+
strategy:
24+
fail-fast: false
25+
matrix:
26+
include:
27+
- os: ubuntu-latest
28+
platform: linux-64
29+
- os: macos-13 # Intel
30+
platform: osx-64
31+
- os: macos-latest # ARM64
32+
platform: osx-arm64
33+
- os: windows-latest
34+
platform: win-64
35+
36+
runs-on: ${{ matrix.os }}
2037

2138
defaults:
2239
run:
@@ -27,7 +44,21 @@ jobs:
2744
with:
2845
fetch-depth: 0
2946

47+
- name: Check if platform should be built
48+
id: should_build
49+
run: |
50+
if [[ "${{ github.event_name }}" != "workflow_dispatch" ]]; then
51+
echo "should_build=true" >> $GITHUB_OUTPUT
52+
elif [[ -z "${{ github.event.inputs.platforms }}" ]]; then
53+
echo "should_build=true" >> $GITHUB_OUTPUT
54+
elif [[ "${{ github.event.inputs.platforms }}" == *"${{ matrix.platform }}"* ]]; then
55+
echo "should_build=true" >> $GITHUB_OUTPUT
56+
else
57+
echo "should_build=false" >> $GITHUB_OUTPUT
58+
fi
59+
3060
- name: Setup Miniconda
61+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
3162
uses: conda-incubator/setup-miniconda@v3
3263
with:
3364
miniconda-version: 'latest'
@@ -39,38 +70,47 @@ jobs:
3970
show-channel-urls: true
4071

4172
- name: Install rattler-build and anaconda-client
73+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
4274
run: |
4375
conda install -c conda-forge rattler-build anaconda-client
4476
4577
- name: Show environment info
78+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
4679
run: |
4780
conda info
4881
conda list | grep -E "(rattler-build|anaconda-client)"
82+
echo "Platform: ${{ matrix.platform }}"
83+
echo "OS: ${{ matrix.os }}"
4984
echo "Building UniLabOS package"
5085
5186
- name: Build conda package
87+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
5288
run: |
5389
rattler-build build -r .conda/recipe.yaml -c uni-lab -c robostack-staging -c conda-forge
5490
5591
- name: List built packages
92+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
5693
run: |
5794
echo "Built packages in output directory:"
5895
find ./output -name "*.conda" | head -10
96+
ls -la ./output/${{ matrix.platform }}/ || echo "${{ matrix.platform }} directory not found"
5997
ls -la ./output/noarch/ || echo "noarch directory not found"
6098
echo "Output directory structure:"
6199
find ./output -type f -name "*.conda"
62100
63101
- name: Prepare artifacts for upload
102+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
64103
run: |
65104
mkdir -p conda-packages-temp
66105
find ./output -name "*.conda" -exec cp {} conda-packages-temp/ \;
67106
echo "Copied files to temp directory:"
68107
ls -la conda-packages-temp/
69108
70109
- name: Upload conda package artifacts
110+
if: steps.should_build.outputs.should_build == 'true'
71111
uses: actions/upload-artifact@v4
72112
with:
73-
name: conda-package-unilabos
113+
name: conda-package-unilabos-${{ matrix.platform }}
74114
path: conda-packages-temp
75115
if-no-files-found: warn
76116
retention-days: 30

recipes/msgs/recipe.yaml

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,6 +1,6 @@
11
package:
22
name: ros-humble-unilabos-msgs
3-
version: 0.10.1
3+
version: 0.10.2
44
source:
55
path: ../../unilabos_msgs
66
target_directory: src

recipes/unilabos/recipe.yaml

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,6 +1,6 @@
11
package:
22
name: unilabos
3-
version: "0.10.1"
3+
version: "0.10.2"
44

55
source:
66
path: ../..

setup.py

Lines changed: 1 addition & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -4,7 +4,7 @@
44

55
setup(
66
name=package_name,
7-
version='0.10.1',
7+
version='0.10.2',
88
packages=find_packages(),
99
include_package_data=True,
1010
install_requires=['setuptools'],

unilabos/app/main.py

Lines changed: 26 additions & 4 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -43,10 +43,11 @@ def convert_argv_dashes_to_underscores(args: argparse.ArgumentParser):
4343
for i, arg in enumerate(sys.argv):
4444
for option_string in option_strings:
4545
if arg.startswith(option_string):
46-
new_arg = arg[:2] + arg[2:len(option_string)].replace("-", "_") + arg[len(option_string):]
46+
new_arg = arg[:2] + arg[2 : len(option_string)].replace("-", "_") + arg[len(option_string) :]
4747
sys.argv[i] = new_arg
4848
break
4949

50+
5051
def parse_args():
5152
"""解析命令行参数"""
5253
parser = argparse.ArgumentParser(description="Start Uni-Lab Edge server.")
@@ -128,6 +129,11 @@ def parse_args():
128129
default="",
129130
help="实验室唯一ID,也可通过环境变量 UNILABOS_MQCONFIG_LABID 设置或传入--config设置",
130131
)
132+
parser.add_argument(
133+
"--skip_env_check",
134+
action="store_true",
135+
help="跳过启动时的环境依赖检查",
136+
)
131137
return parser
132138

133139

@@ -138,6 +144,17 @@ def main():
138144
convert_argv_dashes_to_underscores(args)
139145
args_dict = vars(args.parse_args())
140146

147+
# 环境检查 - 检查并自动安装必需的包 (可选)
148+
if not args_dict.get("skip_env_check", False):
149+
from unilabos.utils.environment_check import check_environment
150+
151+
print_status("正在进行环境依赖检查...", "info")
152+
if not check_environment(auto_install=True):
153+
print_status("环境检查失败,程序退出", "error")
154+
os._exit(1)
155+
else:
156+
print_status("跳过环境依赖检查", "warning")
157+
141158
# 加载配置文件,优先加载config,然后从env读取
142159
config_path = args_dict.get("config")
143160
if os.getcwd().endswith("unilabos_data"):
@@ -151,17 +168,22 @@ def main():
151168
if not os.path.exists(config_path):
152169
print_status(
153170
f"当前工作目录 {working_dir} 未找到local_config.py,请通过 --config 传入 local_config.py 文件路径",
154-
"error")
171+
"error",
172+
)
155173
os._exit(1)
156174
elif os.path.exists(working_dir) and os.path.exists(os.path.join(working_dir, "local_config.py")):
157175
config_path = os.path.join(working_dir, "local_config.py")
158-
elif not config_path and (not os.path.exists(working_dir) or not os.path.exists(os.path.join(working_dir, "local_config.py"))):
176+
elif not config_path and (
177+
not os.path.exists(working_dir) or not os.path.exists(os.path.join(working_dir, "local_config.py"))
178+
):
159179
print_status(f"未指定config路径,可通过 --config 传入 local_config.py 文件路径", "info")
160180
print_status(f"您是否为第一次使用?并将当前路径 {working_dir} 作为工作目录? (Y/n)", "info")
161181
if input() != "n":
162182
os.makedirs(working_dir, exist_ok=True)
163183
config_path = os.path.join(working_dir, "local_config.py")
164-
shutil.copy(os.path.join(os.path.dirname(os.path.dirname(__file__)), "config", "example_config.py"), config_path)
184+
shutil.copy(
185+
os.path.join(os.path.dirname(os.path.dirname(__file__)), "config", "example_config.py"), config_path
186+
)
165187
print_status(f"已创建 local_config.py 路径: {config_path}", "info")
166188
print_status(f"请在文件夹中配置lab_id,放入下载的CA.crt、lab.crt、lab.key重新启动本程序", "info")
167189
os._exit(1)

unilabos/utils/__init__.py

Lines changed: 3 additions & 2 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,7 +1,8 @@
11
from unilabos.utils.log import logger
2+
from unilabos.utils.environment_check import check_environment, EnvironmentChecker
23

34
# 确保日志配置在导入utils包时自动应用
45
# 这样任何导入utils包或其子模块的代码都会自动配置好日志
56

6-
# 导出logger,使其可以通过from unilabos.utils import logger直接导入
7-
__all__ = ['logger']
7+
# 导出logger和环境检查工具,使其可以直接导入
8+
__all__ = ["logger", "check_environment", "EnvironmentChecker"]

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