Alguns arquivos possuem exemplos do teste que não compilam. Ao tentar executar um arquivo pontual no IDEA ele começa a reclamar de todos os arquivos que não "funcionam".
Talvez adicionando todas as exceções e commitando no repositório isso evite que outros devs tenham que realizar o mesmo processo em suas máquinas para visualizar um resultado pontual de outra classe.
No Eclipse não acontece esse problema por compilar apenas o arquivo desejado (o main do arquivo).