docker-matlabmcr2017a/Dockerfile at master · murphygroup/docker-matlabmcr2017a · GitHub

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FROM ubuntu:16.04 as intermediate

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MAINTAINER Ivan E. Cao-Berg <icaoberg@alumni.cmu.edu>
LABEL Description="MATLAB MCR 2017a"
LABEL Vendor="Computational Biology Department at Carnegie Mellon University"
LABEL Web="http://linus.cbd.cmu.edu"
LABEL Version="2017a"
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# UPDATE OS AND INSTALL TOOLS
USER root
ENV DEBIAN_FRONTEND noninteractive
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends apt-utils
RUN apt-get install -y build-essential git \
    unzip \
    xorg \
    wget \
    tree \
    pandoc \
    curl \
    vim
RUN apt-get upgrade -y
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# INSTALL MATLAB MCR 2017A
USER root
RUN echo "Downloading Matlab MCR 2017a"
RUN mkdir /mcr-install && \
    mkdir /opt/mcr
RUN cd /mcr-install && \
    wget -nc http://ssd.mathworks.com/supportfiles/downloads/R2017a/deployment_files/R2017a/installers/glnxa64/MCR_R2017a_glnxa64_installer.zip && \
    cd /mcr-install && \
    echo "Unzipping container" && \
    unzip -q MCR_R2017a_glnxa64_installer.zip && \
    ./install -destinationFolder /opt/mcr -agreeToLicense yes -mode silent && \
    cd / && \
    echo "Removing temporary files" && \
    rm -rvf mcr-install
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FROM ubuntu:16.04
COPY --from=intermediate /opt/mcr /opt/mcr
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# CONFIGURE ENVIRONMENT VARIABLES FOR MCR
RUN mv -v /opt/mcr/v92/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 /opt/mcr/v92/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6.old
ENV LD_LIBRARY_PATH /opt/mcr/v92/runtime/glnxa64:/opt/mcr/v92/bin/glnxa64:/opt/mcr/v92/sys/os/glnxa64
ENV XAPPLRESDIR /opt/mcr/v92/X11/app-defaults
ENV DEBIAN_FRONTEND noninteractive
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends apt-utils
RUN apt-get install -y wget
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# CONFIGURE ENVIRONMENT
ENV DEBIAN_FRONTEND noninteractive
ENV SHELL /bin/bash
ENV USERNAME murphylab
ENV UID 1000
RUN useradd -m -s /bin/bash -N -u $UID $USERNAME
RUN if [ ! -d /home/$USERNAME/ ]; then mkdir /home/$USERNAME/; fi
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