@@ -16,7 +16,6 @@ _python_defaults: &python_defaults
1616 password : $DOCKER_PAT
1717 working_directory : /tmp/src/nibabies
1818
19-
2019_docker_auth : &docker_auth
2120 name : Docker authentication
2221 command : |
@@ -160,7 +159,6 @@ jobs:
160159 - /tmp/docker
161160 - /tmp/images
162161
163-
164162 get_data :
165163 !!merge <<: *python_defaults
166164 working_directory : /home/circleci/data
@@ -279,7 +277,6 @@ jobs:
279277 - store_artifacts :
280278 path : /tmp/data/reports
281279
282-
283280 test_bcp :
284281 !!merge <<: *machine_defaults
285282 environment :
@@ -412,7 +409,7 @@ jobs:
412409 --nthreads 4 -vv --age-months 2 --sloppy \
413410 --surface-recon-method infantfs \
414411 --derivatives precomputed=/tmp/data/${DATASET}-t2only/derivatives/bibsnet \
415- --output-layout bids --anat-only
412+ --output-layout bids --anat-only --cifti-output
416413 - run :
417414 name : Checking outputs of T2-only nibabies anat
418415 command : |
@@ -427,7 +424,6 @@ jobs:
427424 - store_artifacts :
428425 path : /tmp/bcp/derivatives
429426
430-
431427 deploy_docker_patches :
432428 !!merge <<: *machine_defaults
433429 working_directory : *src
@@ -464,7 +460,6 @@ jobs:
464460 docker tag nipreps/nibabies:dev nipreps/nibabies:${CIRCLE_BRANCH#docker/}
465461 docker push nipreps/nibabies:${CIRCLE_BRANCH#docker/}
466462
467-
468463 deploy_docker :
469464 !!merge <<: *machine_defaults
470465 steps :
@@ -503,7 +498,6 @@ jobs:
503498 fi
504499 fi
505500
506-
507501 test_deploy_pypi :
508502 !!merge <<: *python_defaults
509503 steps :
@@ -559,7 +553,6 @@ jobs:
559553 - store_artifacts :
560554 path : /tmp/src/nibabies/wrapper/dist
561555
562-
563556 deploy_pypi :
564557 !!merge <<: *python_defaults
565558 steps :
@@ -584,14 +577,12 @@ jobs:
584577 # upload wrapper
585578 python -m twine upload wrapper/dist/nibabies*
586579
587-
588580 deployable :
589581 docker :
590582 - image : busybox:latest
591583 steps :
592584 - run : echo Deploying!
593585
594-
595586workflows :
596587 version : 2
597588 build_test_deploy :
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