FIX/TEST: Finish fixing traits

Author: effigies

nipype/interfaces/freesurfer/petsurfer.py

@@ -511,7 +511,7 @@ class MRTMInputSpec(GLMFitInputSpec):
         File(exists=True),
         File(exists=True),
         mandatory=True,
-        argstr="--mrtm1 %s %s...",
+        argstr="--mrtm1 %s %s",
         desc="RefTac TimeSec : perform MRTM1 kinetic modeling",
     )
 
@@ -523,7 +523,7 @@ class MRTM(GLMFit):
     --------
     >>> mrtm = MRTM()
     >>> mrtm.inputs.in_file = 'tac.nii'
-    >>> mrtm.inputs.mrtm1 = [('ref_tac.dat', 'timing.dat')]
+    >>> mrtm.inputs.mrtm1 = ('ref_tac.dat', 'timing.dat')
     >>> mrtm.inputs.glm_dir = 'mrtm'
     >>> mrtm.cmdline
     'mri_glmfit --glmdir mrtm --y tac.nii --mrtm1 ref_tac.dat timing.dat'
@@ -538,7 +538,7 @@ class MRTM2InputSpec(GLMFitInputSpec):
         File(exists=True),
         traits.Float,
         mandatory=True,
-        argstr="--mrtm2 %s %s %f...",
+        argstr="--mrtm2 %s %s %f",
         desc="RefTac TimeSec k2prime : perform MRTM2 kinetic modeling",
     )
 
@@ -549,7 +549,7 @@ class MRTM2(GLMFit):
     --------
     >>> mrtm2 = MRTM2()
     >>> mrtm2.inputs.in_file = 'tac.nii'
-    >>> mrtm2.inputs.mrtm2 = [('ref_tac.dat', 'timing.dat', 0.07872)]
+    >>> mrtm2.inputs.mrtm2 = ('ref_tac.dat', 'timing.dat', 0.07872)
     >>> mrtm2.inputs.glm_dir = 'mrtm2'
     >>> mrtm2.cmdline
     'mri_glmfit --glmdir mrtm2 --y tac.nii --mrtm2 ref_tac.dat timing.dat 0.078720'
@@ -564,7 +564,7 @@ class LoganRefInputSpec(GLMFitInputSpec):
         File(exists=True),
         traits.Float,
         mandatory=True,
-        argstr="--logan %s %s %g...",
+        argstr="--logan %s %s %g",
         desc="RefTac TimeSec tstar   : perform Logan kinetic modeling",
     )
 
@@ -575,7 +575,7 @@ class LoganRef(GLMFit):
     --------
     >>> logan = LoganRef()
     >>> logan.inputs.in_file = 'tac.nii'
-    >>> logan.inputs.logan = [('ref_tac.dat', 'timing.dat', 2600)]
+    >>> logan.inputs.logan = ('ref_tac.dat', 'timing.dat', 2600)
     >>> logan.inputs.glm_dir = 'logan'
     >>> logan.cmdline
     'mri_glmfit --glmdir logan --y tac.nii --logan ref_tac.dat timing.dat 2600'

nipype/interfaces/freesurfer/tests/test_auto_LoganRef.py

@@ -90,7 +90,7 @@ def test_LoganRef_inputs():
             xor=["cortex"],
         ),
         logan=dict(
-            argstr="--logan %s %s %g...",
+            argstr="--logan %s %s %g",
             mandatory=True,
         ),
         mask_file=dict(

nipype/interfaces/freesurfer/tests/test_auto_MRTM.py

@@ -97,7 +97,7 @@ def test_MRTM_inputs():
             extensions=None,
         ),
         mrtm1=dict(
-            argstr="--mrtm1 %s %s...",
+            argstr="--mrtm1 %s %s",
             mandatory=True,
         ),
         mrtm2=dict(

nipype/interfaces/freesurfer/tests/test_auto_MRTM2.py

@@ -100,7 +100,7 @@ def test_MRTM2_inputs():
             argstr="--mrtm1 %s %s",
         ),
         mrtm2=dict(
-            argstr="--mrtm2 %s %s %f...",
+            argstr="--mrtm2 %s %s %f",
             mandatory=True,
         ),
         nii=dict(