Tomogram Tilt Images Too Big to Load

[AriaGarrett]

My data is always too large to show a preview of the tomogram tilts (not the CTF or other feedback images though). This wasn't a problem until I got to needing to do some particle picking curation, which uses the preview image GUI for you to edit the particles. Any thoughts on a work around or setting I can try? I've tried binning it pretty high, but usually it either errors out or is still too large to show the preview. Thanks!

Here's an example of what the log will look like:
2026-01-21 15:17:24 [ERROR] pyp/system/local_run.py:73 | montage: cache resources exhausted `g3-sq1-tg4_ts_001_g3-sq1-tg4_ts_rec.png' @ error/cache.c/OpenPixelCache/4095. 41 montage: memory allocation failed `g3-sq1-tg4_ts_001_g3-sq1-tg4_ts_rec.png' @ error/png.c/WriteOnePNGImage/9144. 42 montage: No IDATs written into file `g3-sq1-tg4_ts_001_g3-sq1-tg4_ts_rec.png' @ error/png.c/MagickPNGErrorHandler/1642.

or 195 2026-01-21 17:08:59 [INFO] pyp/system/local_run.py:66 | /opt/IMOD/bin/mrc2tif -z 0,340 -p -S -0.01725336950039491,0.018323834578040987 sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.rec sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip 196 2026-01-21 17:10:14 [INFO] pyp/system/local_run.py:71 | Writing PNG images. ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 197 198 2026-01-21 17:10:14 [INFO] pyp/system/local_run.py:66 | /usr/bin/montage -resize 1964x1964 -geometry +0+0 -tile 19x sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.000.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.001.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.002.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.003.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.004.png 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sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.245.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.246.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.247.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.248.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.249.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.250.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.251.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.252.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.253.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.254.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.255.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.256.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.257.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.258.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.259.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.260.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.261.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.262.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.263.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.264.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.265.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.266.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.267.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.268.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.269.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.270.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.271.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.272.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.273.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.274.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.275.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.276.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.277.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.278.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.279.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.280.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.281.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.282.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.283.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.284.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.285.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.286.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.287.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.288.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.289.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.290.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.291.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.292.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.293.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.294.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.295.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.296.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.297.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.298.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.299.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.300.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.301.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.302.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.303.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.304.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.305.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.306.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.307.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.308.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.309.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.310.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.311.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.312.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.313.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.314.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.315.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.316.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.317.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.318.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.319.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.320.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.321.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.322.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.323.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.324.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.325.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.326.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.327.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.328.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.329.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.330.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.331.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.332.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.333.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.334.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.335.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.336.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.337.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.338.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.339.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_flip.340.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_rec.png 199 2026-01-21 17:10:37 [ERROR] pyp/system/local_run.py:73 | montage: cache resources exhausted sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_rec.png' @ error/cache.c/OpenPixelCache/4095.
200 montage: memory allocation failed sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_rec.png' @ error/png.c/WriteOnePNGImage/9144. 201 montage: No IDATs written into file sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_rec.png' @ error/png.c/MagickPNGErrorHandler/1642.
202
203 2026-01-21 17:10:43 [INFO] pyp/system/local_run.py:66 | /usr/bin/convert image.png sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts.webp
204 2026-01-21 17:10:46 [INFO] pyp/system/local_run.py:66 | /usr/bin/montage side1.png side2.png -mode concatenate -tile 1x sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_sides.webp
205 2026-01-21 17:10:46 [INFO] /opt/pyp/bin/run/pyp:75 | Ploting ctf and tomo webp's took: 2m 3.4s
206 2026-01-21 17:10:50 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:55 | Saving sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_vir0000.txt
207 2026-01-21 17:10:50 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:49 | Updating sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts.pkl
208 2026-01-21 17:10:50 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:55 | Saving sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts.tlt
209 2026-01-21 17:10:50 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:55 | Saving sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts.xf
210 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:53 | Keeping existing sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_rec.png
211 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:53 | Keeping existing sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_raw.webp
212 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:53 | Keeping existing sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_ali.webp
213 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:53 | Keeping existing sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts_sides.webp
214 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/inout/utils/core.py:53 | Keeping existing sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts.webp
215 2026-01-21 17:10:51 [INFO] pyp/system/db_comm.py:139 | Series sq10-gp2_ts_002_sq10-gp2_ts entered into database successfully
216 2026-01-21 17:10:52 [INFO] /opt/pyp/bin/run/pyp:75 | Save result and clean scratch took: 6.1s
217 2026-01-21 17:10:52 [INFO] /opt/pyp/bin/run/pyp:75 | Total time in tomo_swarm 10m 38.5s seconds
218 2026-01-21 17:10:52 [INFO] /opt/pyp/bin/run/pyp:4209 | nextPYP (tomoswarm) finished successfully
219 /opt/pyp/src/pyp/inout/image/mrc.py:850: RuntimeWarning: overflow encountered in scalar multiply
220 image = numpy.reshape(numpy.fromfile(f, dt, y * x * z), [z, y, x]).astype(``

[abartesaghi]

I can't tell from the logs which version you're running, but this issue should have been resolved in recent versions of nextPYP. At this point, I recommend upgrading to the release candidate 0.7.3. It hasn't been officially released yet, but it is stable and has many bug fixes. You can get the corresponding installer using:

wget https://nextpyp.app/files/pyp/0.7.3/install -O install

Then, follow the standard upgrade instructions and let us know if the problem is resolved.