Databases-on-SAGA/current_structure.txt at main · rungitta/Databases-on-SAGA · GitHub

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├── admin
│   ├── Databases-on-SAGA
│   ├── logs
│   └── test
├── blast
│   ├── 04-02-2021
│   ├── 2021-05-27
│   ├── 2021-07-29
│   ├── 25-10-2019
│   ├── latest -> /cluster/shared/databases/blast/2021-07-29
│   └── scripts
├── bowtie
├── BUSCO
│   ├── 12-08-2020
│   ├── 2021-05-27
│   ├── 2021-07-29
│   └── latest -> /cluster/shared/databases/BUSCO/2021-07-29
├── homer
├── Kraken2
│   ├── 12-08-2020-no-NT
│   ├── 13-04-2021-no-NT
│   ├── 2021-05-25
│   ├── 2021-07-29
│   ├── 2.0.9-beta-foss-2018b-Perl-5.28.0
│   ├── 25-06-2020
│   ├── kraken2
│   ├── latest -> /cluster/shared/databases/Kraken2/2021-07-29
│   └── logs
├── module-trigers
├── references
│   ├── admin
│   ├── Arabidopsis_thaliana
│   ├── Bacillus_cereus_ATCC_10987
│   ├── Bacillus_subtilis_168
│   ├── Bos_taurus
│   ├── Caenorhabditis_elegans
│   ├── Canis_familiaris
│   ├── Danio_rerio
│   ├── Drosophila_melanogaster
│   ├── Enterobacteriophage_lambda
│   ├── Equus_caballus
│   ├── Escherichia_coli_K_12_DH10B
│   ├── Escherichia_coli_K_12_MG1655
│   ├── Gallus_gallus
│   ├── Glycine_max
│   ├── Homo_sapiens
│   ├── Macaca_mulatta
│   ├── Mus_musculus
│   ├── Mycobacterium_tuberculosis_H37RV
│   ├── Oryza_sativa_japonica
│   ├── Ovis_aries
│   ├── Pan_troglodytes
│   ├── PhiX
│   ├── Pseudomonas_aeruginosa_PAO1
│   ├── Rattus_norvegicus
│   ├── Rhodobacter_sphaeroides_2.4.1
│   ├── Saccharomyces_cerevisiae
│   ├── Schizosaccharomyces_pombe
│   ├── Sorangium_cellulosum_So_ce_56
│   ├── Sorghum_bicolor
│   ├── Staphylococcus_aureus_NCTC_8325
│   ├── Sus_scrofa
│   └── Zea_mays
└── uniprot
    ├── 2021-04-07
    └── test

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