Improve github actions (#46)

* Improve github actions

* url

* urls

* check

* urls

* check urls

Author: xadupre

.github/workflows/black.yml .github/workflows/black-ruff.yml.github/workflows/black.yml renamed to .github/workflows/black-ruff.yml

@@ -1,4 +1,4 @@
-name: Black Format Checker
+name: Black + Ruff Format Checker
 on: [push, pull_request]
 jobs:
   black-format-check:
@@ -9,3 +9,8 @@ jobs:
         with:
           options: "--diff --check"
           src: "."
+  ruff-format-check:
+    runs-on: ubuntu-latest
+    steps:
+      - uses: actions/checkout@v3
+      - uses: chartboost/ruff-action@v1

.github/workflows/check-urls.yml

@@ -42,6 +42,6 @@ jobs:
         print_all: false
         timeout: 5
         retry_count# : 3
-        exclude_urls: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00990252/document,https://github.com/onnx/models/raw/main/vision/classification/mobilenet/model/mobilenetv2-12.onnx
+        exclude_urls: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00990252/document,https://github.com/onnx/models/raw/main/vision/classification/mobilenet/model/mobilenetv2-12.onnx,https://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/1510/1510.04863.pdf,https://hal.science/hal-01125940
         exclude_patterns: https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/r/e3d83ab3-dc52-4c99-abaf-8a38050cc68c,https://github.com/onnx/models/raw/main/vision/classification/mobilenet/model/mobilenetv2-12.onnx
         # force_pass : true

.local.jenkins.win.yml

@@ -1,4 +1,10 @@
 
+.. image:: https://github.com/sdpython/sphinx-runpython/raw/main/_doc/_static/logo.png
+    :width: 120
+
+mlstatpy: détours mathématiques autour du machine learning
+==========================================================
+
 .. image:: https://ci.appveyor.com/api/projects/status/5env33qptorgshaq?svg=true
     :target: https://ci.appveyor.com/project/sdpython/mlstatpy
     :alt: Build Status Windows
@@ -11,7 +17,7 @@
 
 .. image:: https://img.shields.io/badge/license-MIT-blue.svg
     :alt: MIT License
-    :target: http://opensource.org/licenses/MIT
+    :target: https://opensource.org/license/MIT/
 
 .. image:: https://codecov.io/github/sdpython/mlstatpy/coverage.svg
     :target: https://codecov.io/github/sdpython/mlstatpy/
@@ -20,11 +26,6 @@
     :alt: GitHub Issues
     :target: https://github.com/sdpython/mlstatpy/issues
 
-.. _l-README:
-
-mlstatpy: détours mathématiques autour du machine learning
-==========================================================
-
 Le module contient essentiellement des digressions mathématiques
 autour du machine learning. Parmi les choses intéressantes,
 une courbe *ROC* avec intervalle de confiance, détection
@@ -40,5 +41,4 @@ automated segment detection in a image, some simple autocomplete
 algorithm, a graph edit distance, some helpers on Wikipedia data,
 an algorithm to convert decision trees into neural network.
 
-* `GitHub/mlstatpy <https://github.com/sdpython/mlstatpy/>`_
-* `documentation <https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/>`_
+* `documentation <https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/dev/>`_

.travis.yml

@@ -14,7 +14,8 @@ Avec les préfixes, un noeud a au plus 27 (26 lettres + espaces)
 caractères suivant possibles. Si le préfixe a des synonymes,
 rien n'empêche de relier ce noeud avec les successeurs de ses
 synonymes.
-A ce sujet, voir `Context-Sensitive Query Auto-Completion <http://technion.ac.il/~nkraus/papers/fr332-bar-yossef.pdf>`_,
+A ce sujet, voir `Context-Sensitive Query Auto-Completion
+<https://db-event.jpn.org/deim2018/data/papers/149.pdf>`_,
 de Ziv Bar-Yossef et Naama Kraus.
 
 Source

README.rst

@@ -185,7 +185,7 @@
     "LAESA": "https://tavianator.com/aesa/",
     "LAPACK": "http://www.netlib.org/lapack/",
     "mlinsights": "http://www.xavierdupre.fr/app/mlinsights/helpsphinx/index.html",
-    "mlstatpy": "https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/",
+    "mlstatpy": "https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/dev/",
     "numpy": (
         "https://www.numpy.org/",
         ("https://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.{0}.html", 1),

_doc/c_nlp/completion_digression.rst

@@ -52,7 +52,7 @@ Xavier Dupré
 
     .. image:: https://img.shields.io/badge/license-MIT-blue.svg
         :alt: MIT License
-        :target: http://opensource.org/licenses/MIT
+        :target: https://opensource.org/license/MIT/
 
     .. image:: https://codecov.io/github/sdpython/mlstatpy/coverage.svg
         :target: https://codecov.io/github/sdpython/mlstatpy

_doc/conf.py

@@ -539,7 +539,7 @@
    "source": [
     "## ROC - TPR / FPR\n",
     "\n",
-    "We do the same with the class this module provides [ROC](https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/c_metric/roc.html).\n",
+    "We do the same with the class this module provides [ROC](https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/dev/c_metric/roc.html).\n",
     "\n",
     "* TPR = True Positive Rate\n",
     "* FPR = False Positive Rate\n",

_doc/index.rst

@@ -476,7 +476,7 @@
    "source": [
     "## Un diagramme de Voronoï proche\n",
     "\n",
-    "On applique la formule définie par [Régression logistique, diagramme de Voronoï, k-Means](https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/c_ml/lr_voronoi.html) et on résoud le système linéaire défini par :\n",
+    "On applique la formule définie par [Régression logistique, diagramme de Voronoï, k-Means](https://sdpython.github.io/doc/mlstatpy/dev/c_ml/lr_voronoi.html) et on résoud le système linéaire défini par :\n",
     "\n",
     "$$\\begin{array}{ll}\n",
     "&\\left\\{\\begin{array}{l}\\left<L_i - L_j, P_i \\right> + B_i - B_j = - \\left\\{ \\left<L_i - L_j, P_j \\right> + B_i - B_j \\right \\} \\\\ P_i-  P_j - \\left<P_i - P_j, \\frac{L_i-L_j}{\\Vert L_i-L_j\\Vert} \\right> \\frac{L_i-L_j}{\\Vert L_i-L_j\\Vert }=0 \\end{array} \\right.\n",