99 name : python
1010- count : 301
1111 name : centos
12- - count : 287
12+ - count : 288
1313 name : alpine
1414- count : 258
1515 name : ghcr.io/mkandes/naked-singularity
1616- count : 253
1717 name : aibasel/downward
18- - count : 236
18+ - count : 237
1919 name : continuumio/miniconda3
2020- count : 134
2121 name : tensorflow/tensorflow
3030- count : 77
3131 name : neurodebian
3232- count : 56
33- name : conda/miniconda3
34- - count : 55
3533 name : fedora
34+ - count : 56
35+ name : conda/miniconda3
3636- count : 52
3737 name : continuumio/miniconda
3838- count : 51
@@ -73,12 +73,12 @@ bases:
7373 name : osrf/ros
7474- count : 25
7575 name : nipy/heudiconv
76- - count : 25
77- name : continuumio/anaconda3
7876- count : 24
79- name : rockylinux
80- - count : 23
8177 name : pennlinc/xcp_d
78+ - count : 24
79+ name : rockylinux
80+ - count : 24
81+ name : continuumio/anaconda3
8282- count : 22
8383 name : khanlab/tar2bids
8484- count : 21
@@ -101,6 +101,8 @@ bases:
101101 name : bioconductor/bioconductor_docker
102102- count : 16
103103 name : rocker/verse
104+ - count : 15
105+ name : nipreps/nibabies
104106- count : 15
105107 name : khanlab/neuroglia-dwi
106108- count : 15
@@ -111,8 +113,6 @@ bases:
111113 name : jtchilders/singularity_image_recipes
112114- count : 14
113115 name : khanlab/hippunfold
114- - count : 14
115- name : nipreps/nibabies
116116- count : 14
117117 name : ebothmann/sherpa-singularity
118118- count : 14
@@ -789,6 +789,10 @@ bases:
789789 name : maplesond/portcullis
790790- count : 2
791791 name : vnmd/freesurfer_8.0.0
792+ - count : 2
793+ name : biocontainers/blast
794+ - count : 2
795+ name : biocontainers/bcftools
792796- count : 2
793797 name : scleveland/centos7-base-singularity
794798- count : 2
@@ -969,6 +973,8 @@ bases:
969973 name : ../../R/r-minimal/r-minimal_3.5.1.simg
970974- count : 2
971975 name : ../../R/r/r_3.5.1.simg
976+ - count : 2
977+ name : registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure
972978- count : 2
973979 name : ecpe4s/ubuntu20.04-oneapi-x86_64
974980- count : 2
@@ -1027,10 +1033,6 @@ bases:
10271033 name : sorcerer01/opensees
10281034- count : 1
10291035 name : biocontainers/samtools
1030- - count : 1
1031- name : biocontainers/bcftools
1032- - count : 1
1033- name : biocontainers/blast
10341036- count : 1
10351037 name : alantrrs/py-faster-rcnn
10361038- count : 1
@@ -1469,6 +1471,8 @@ bases:
14691471 name : centos7.sif
14701472- count : 1
14711473 name : cyberbotics/webots
1474+ - count : 1
1475+ name : continuumio/miniconda3@sha256
14721476- count : 1
14731477 name : spark.img
14741478- count : 1
@@ -1707,6 +1711,8 @@ bases:
17071711 name : singularity_libs_mpich
17081712- count : 1
17091713 name : rootproject/root
1714+ - count : 1
1715+ name : biocontainers/{{tool_name}}
17101716- count : 1
17111717 name : jupyter/scipy-notebook
17121718- count : 1
@@ -2149,8 +2155,6 @@ bases:
21492155 name : patroonorg/patroonrs
21502156- count : 1
21512157 name : r-minimal/r-minimal_3.5.1.simg
2152- - count : 1
2153- name : registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure
21542158- count : 1
21552159 name : electronioncollider/jleic
21562160- count : 1
@@ -2204,19 +2208,19 @@ bases:
22042208- count : 1
22052209 name : tin6150/r4eta
22062210bootstraps :
2207- - count : 7344
2211+ - count : 7353
22082212 name : docker
22092213- count : 511
22102214 name : shub
2211- - count : 431
2215+ - count : 433
22122216 name : debootstrap
22132217- count : 386
22142218 name : library
22152219- count : 344
22162220 name : oras
22172221- count : 214
22182222 name : localimage
2219- - count : 178
2223+ - count : 182
22202224 name : yum
22212225- count : 35
22222226 name : zypper
@@ -2273,14 +2277,14 @@ orgs:
22732277 name : twongjirad
22742278- count : 8
22752279 name : vanessa
2280+ - count : 8
2281+ name : biocontainers
2282+ - count : 8
2283+ name : continuumio
22762284- count : 8
22772285 name : nvidia
22782286- count : 7
22792287 name : nvcr.io/hpc
2280- - count : 7
2281- name : biocontainers
2282- - count : 7
2283- name : continuumio
22842288- count : 6
22852289 name : nipreps
22862290- count : 6
@@ -3249,7 +3253,7 @@ orgs:
32493253 name : tin6150
32503254tags :
32513255 latest : 778
3252- other : 6899
3256+ other : 6908
32533257versions :
32543258 /nrs/funke/singularity/linajea/pylp_base :
32553259 v1.5.img : 1
@@ -3362,6 +3366,7 @@ versions:
33623366 ' 3.19 ' : 1
33633367 ' 3.20 ' : 9
33643368 3.20.0 : 1
3369+ ' 3.22 ' : 1
33653370 ' 3.4 ' : 2
33663371 ' 3.5 ' : 1
33673372 ' 3.6 ' : 4
@@ -3635,6 +3640,10 @@ versions:
36353640 RELEASE_3_11 : 1
36363641 biocontainers/bamtools :
36373642 latest : 1
3643+ biocontainers/bcftools :
3644+ 1.19--h8b25389_0 : 1
3645+ biocontainers/blast :
3646+ 2.15.0 : 1
36383647 biocontainers/bowtie2 :
36393648 v2.4.1_cv1 : 1
36403649 biocontainers/fastqc :
@@ -3643,6 +3652,8 @@ versions:
36433652 v0.11.9_cv8 : 1
36443653 biocontainers/t-coffee :
36453654 v12.00.7fb08c2-4-deb_cv1 : 1
3655+ biocontainers/{{tool_name}} :
3656+ ' {{tool_version}} ' : 1
36463657 biocorecrg/debian-perlbrew :
36473658 buster : 1
36483659 biocorecrg/debian-perlbrew-pyenv3-java :
@@ -3835,6 +3846,8 @@ versions:
38353846 4.8.2 : 11
38363847 4.9.2 : 2
38373848 latest : 33
3849+ continuumio/miniconda3@sha256 :
3850+ 3a2017213a16daff5bc8dec8571354249c3370d6b0d64ac78e8538257ce42d4c : 1
38383851 cornellcac/presto :
38393852 latest : 1
38403853 cornellcac/pulsar-pipeline :
@@ -4075,7 +4088,7 @@ versions:
40754088 ' 34 ' : 5
40764089 ' 35 ' : 3
40774090 ' 36 ' : 2
4078- ' 40 ' : 4
4091+ ' 40 ' : 5
40794092 latest : 3
40804093 fempar/fempar-env :
40814094 gnu-debug_p4est-parallel : 1
@@ -4882,6 +4895,7 @@ versions:
48824895 25.0.1 : 1
48834896 25.0.2 : 1
48844897 25.1.0 : 1
4898+ 25.1.1 : 1
48854899 nipreps/nirodents :
48864900 0.2.1 : 1
48874901 nipreps/smriprep :
@@ -5023,7 +5037,7 @@ versions:
50235037 22.04-py3 : 3
50245038 22.05-py3 : 1
50255039 22.08-py3 : 1
5026- 23.09 -py3 : 1
5040+ 25.06 -py3 : 1
50275041 nvcr.io/nvidia/rapidsai/rapidsai-core :
50285042 22.08-cuda11.0-runtime-ubuntu20.04-py3.9 : 1
50295043 nvcr.io/nvidia/riva/riva-speech :
@@ -5352,6 +5366,7 @@ versions:
53525366 0.10.5 : 1
53535367 0.10.6 : 1
53545368 0.10.7 : 1
5369+ 0.11.0 : 1
53555370 0.6.0 : 1
53565371 0.6.1 : 1
53575372 0.6.2 : 1
@@ -5805,6 +5820,7 @@ versions:
58055820 ' 20.04 ' : 1
58065821 registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure :
58075822 2.0.0 : 1
5823+ 2.11.0 : 1
58085824 repronim/reproin :
58095825 0.11.3 : 1
58105826 0.11.6 : 1
0 commit comments