这里是所有分析汇总流程
一级文件夹名字为分类名称，DEG/GENOME/Integration
二级文件夹名字为方法名称
到时这里会是一个目录的啦
[TOC]
DEG Cell type adjustment— Connectivity Outlier Covariates—VOOM Network—WGCNA Module conservation—Zsummary Functional enrichment—DAVID, Gorilla
Methylation
DMP, DMR— Feature—ChromHMM GWAS overlap—INRICH,
Call Variants
Imputation
LDSR—LD regression
π1 statistics
GWAS
CVAS
RVAS
QTL—matrix eQTL
Causal relationship—SMR, NEO, CIT, metaSCAN
Evolution HAR Dn/Ds
每个文件夹至少包括两个部分 1.code 2.说明文档
请在code前加上作为代码描述部分
####
# Describe: 代码作用
# Environment:语言环境
# Author: 作者
# Input:输入文件
# Output:输出文件
# Package requirement:相关依赖包
# Data: 时间
####
例:
####
# Describe: use affy packages to preprocess .CEL
# Environment: R 3.3.2
# Author: Yu Chen (SKLMG)
# Input:.CEL file
# Output:Expression matrix
# R Package requirement: affy, tcltk
# Data: 2017-08-15
####
对于说明文档 请加上流程的具体作用以便学习