feat: 实现MCP服务以统一业务逻辑和状态管理

- 新增 mcp_service 文件，移除原本的 src/agents/common/mcp.py，所有功能合并到mcp_service，MCP服务来处理服务器配置的增删改查操作、数据库与缓存之间的同步以及MCP客户端和工具的管理。
- 将重构的 MCP 和现有智能体做适配，引入全局缓存和状态管理机制用于MCP服务器和工具。
- 数据库表更新，在MCPServer模型中为StdIO传输类型添加了command和args字段。
- 其他代码优化、增强样式以提升用户体验和可读性。

Author: xerrors

docs/latest/advanced/agents-config.md

@@ -106,7 +106,7 @@ async def get_graph(self):
 
 系统会根据配置自动组装工具集合，涵盖知识图谱查询、向量检索生成的动态工具、MySQL 只读查询能力、Tavily 搜索以及所有注册的 MCP 工具。
 
-工具的启用状态和描述由配置文件或环境变量决定，当依赖缺失时会被中间件自动忽略，从而避免在图中加载不可用能力。MCP Server 的接入方式保持不变，只需在 `src/agents/common/mcp.py` 的 `MCP_SERVERS` 中填入服务地址与 `transport` 类型，如需更多范式可参阅 LangChain 官方文档。
+工具的启用状态和描述由配置文件或环境变量决定，当依赖缺失时会被中间件自动忽略，从而避免在图中加载不可用能力。MCP Server 的接入方式保持不变，只需在 `src/services/mcp_service.py` 的 `MCP_SERVERS` 中填入服务地址与 `transport` 类型，如需更多范式可参阅 LangChain 官方文档。
 
 ### MCP 服务器配置方式
 
@@ -198,23 +198,25 @@ MCP_SERVERS = {
 
 ### 动态工具加载
 
-系统支持动态加载 MCP 工具：
+系统提供统一的 MCP 服务层 (`src/services/mcp_service.py`) 封装所有 MCP 相关操作。
+
+#### 智能体获取工具（自动过滤禁用工具）
+
+智能体应使用 `get_enabled_mcp_tools()` 获取工具，该函数会自动过滤 `disabled_tools` 中的工具：
 
 ```python
-from src.agents.common.mcp import get_mcp_tools, add_mcp_server
+from src.services.mcp_service import get_enabled_mcp_tools, add_mcp_server
 
-# 获取特定服务器的工具
-tools = await get_mcp_tools("sequentialthinking")
+# 获取指定服务器的工具（自动过滤 disabled_tools）
+tools = await get_enabled_mcp_tools("sequentialthinking")
 
 # 动态添加新的 MCP 服务器
 add_mcp_server("custom-server", {
     "url": "https://your-mcp-server.com/mcp",
     "transport": "streamable_http"
 })
-
-# 获取所有 MCP 工具
-all_tools = await get_all_mcp_tools()
 ```
+
 ### MySQL 数据库
 
 在 数据库报表助手（SqlReporterAgent） 中，可以通过配置下面环境变量，让 Agent 能够连接到 MySQL 数据库。并通过执行 SQL 查询，获取数据库中的数据。

docs/latest/intro/quick-start.md

@@ -170,6 +170,10 @@ $env:HTTPS_PROXY="http://IP:PORT"
 
 如果已配置代理但构建失败，尝试移除代理后重试。
 
+如果出现，FetchError: request to https://registry.npmjs.org/npm failed, reason: connect ECONNREFUSED 127.0.0.1:7890
+
+新建一个终端重新执行，并确保没有代理干扰。
+
 </details>
 
 <details>