ファイル名でアンダーバーが入るとエラーが起こる

[yyoshiaki]

fileが
RAW_C_1_1.fastq.gz
みたいな名前だったので
experimental_matrix.csv
の
fastq(PREFIX)
の欄に

RAW_C_1
と書きました
それで動かすと

+ '[' false = true ']'
+ MAX_SPOT_ID=
+ echo experimental_matrix.csv
experimental_matrix.csv
+ cat experimental_matrix.csv
RAW_3H3,3H_3,PE,activated+ [[ -f tximport_R.R ]]
+ rm tximport_R.R
+ cp ../ikra/tximport_R.R ./

となってexperimental_matrix.csvの読み込みに失敗しました。
fileの名前に問題があるのではと思いRAW_C_1_1.fastq.gzをC1_1.fastq.gzとしたら問題なく動きました
つまり途中に_1などがあると問題が出るということのような気がしました。