CIM-11-MMS en OWL

Le répertoire contient les scripts (java) pour extraire et convertir la CIM-11 MMS à partir des APIs de l'OMS .

La création du fichier de la CIM-11-MMS passe par 4 étapes (qui va inclure le français et l'anglais) :

1. Génrer le fichier en OWL, qui est le format utilisé sur le SMT.
2. Concaténer les deux versions en français en anglais pour au final avoir un seule fichier OWL comme celui publié sur le SMT.

Génerer les deux fichier FR et EN en OWL

1. Mettre à jours le fichier de configurations:

Dans le fichier configuration.properties, mettre à  jour les paramètres suivants :

- le paramètre pour la langue :

icd_language = fr 

- le paramètre pour l'URI d'accès à l'API de l'OMS :

entityURI = https://id.who.int/icd/release/11/2024-01/mms

- les paramètres de connexion à l'API :

Paramètres sécurités d'acces à  la API CIM11

TOKEN_ENPOINT = https://icdaccessmanagement.who.int/connect/token
CLIENT_ID = ***
CLIENT_SECRET = ***
SCOPE = icdapi_access
GRANT_TYPE = client_credentials

2. Lancer le script de géneration du fichier :

`java -jar icd11-owl.jar owlCim11Mms -l fr -o CIM11_FR.owl `.

`java -jar icd11-owl.jar owlCim11Mms -l en -o CIM11_EN.owl `.

Concaténation des version en français et en anglais

1. Lancer le script de concaténation:

Rq: modifier l'URI de l'ontology FR avant de lancer le script

java -jar icd11-owl.jar concatenateCim11 -owl_fr CIM11_FR.owl -owl_en CIM11_EN.owl -owl_complet CIM11_COMPLETE_FR_EN.owl