fix(build-run): 统一命令对话框的继承与校验逻辑

[lulu-sk]

将 Build/Run 命令对话框的草稿处理抽离为独立辅助模块，
统一默认值、配置克隆、命令有效性判断与持久化前的标准化逻辑。
子 worktree 在“覆盖当前节点”和“继承父项目”之间切换时，
会同步对齐草稿内容；保存到父项目时会清理当前节点的覆盖配置，
从而真正恢复对父项目命令的继承行为。

同时将执行失败和保存失败从原生 alert 改为应用内提示弹窗，
避免打断当前弹窗的焦点与交互流程，并补充对应单元测试。

补充修复：

• 将 hasBuildRunCommand 声明为类型守卫，修复 resolveEffectiveBuildRunCommand 无法通过 web 类型检查的问题。

产品层面：

• Build/Run 配置面板在 worktree/父项目之间切换时行为更一致；
• 恢复继承与错误提示更稳定，减少误保存和交互中断。