LAMMPS 时间估算器使用说明

简介

lammps_time_estimator.py 是一个用于估算 LAMMPS 模拟运行时间的 Python 程序。它通过读取 log.lammps 文件中的循环时间数据和输入文件中的总步数，计算出在相同核心数下运行整个模拟所需的时间。

先决条件

• 安装了 Python 3.x
• LAMMPS 已经运行并生成了 log.lammps 文件
• LAMMPS 的输入文件命名为 in.*（例如 in.input）

使用方法

1. 准备工作

确保以下文件在当前工作目录中：

• log.lammps：包含 LAMMPS 运行日志
• in.*：包含 LAMMPS 输入的文件，例如 in.input

2. 下载或创建脚本

下载或复制代码保存为 lammps_time_estimator.py

3. 运行脚本

默认使用方式

在终端或命令行中运行以下命令：

python lammps_time_estimator.py

此命令将自动查找当前目录中的 log.lammps 文件和以 in. 开头的输入文件。

指定文件和步数

你也可以指定 log.lammps 文件和输入文件，或者直接指定总步数：

python lammps_time_estimator.py -l log.lammps -i in.input -s 500000

4. 查看结果

脚本将输出读取到的 loop time，procs 和 steps 信息，并显示估算的总运行时间。例如：

Extracted: Loop time = 0.764362s, Procs = 30, Steps = 67
Estimated time for 500000 steps: 5.10 hours (assuming the same number of processors: 30)

注意事项

• 请确保 log.lammps 文件和输入文件的路径正确。
• 脚本假设所有 Loop time 行中的 procs 数量相同。
• 输出的估算时间是在相同核心数的前提下计算的。

常见问题

Q: 如果输入文件中有多个 run 命令，如何处理？ A: 脚本会自动累加所有 run 命令中的步数。

Q: 如果我有多个 Loop time 行，如何计算？ A: 脚本会读取所有的 Loop time 行，并计算平均每步的时间以估算总时间。